Vedle spíše popularizačních titulů se Berne stal i autorem knihy Transakční analýza v psychoterapii, zamýšlené jako základní odborná příručka pro praktikování transakční analýzy. Zakladatel TA se v knize zabývá přehledem transakčněanalytických poznatků: popisem ego-stavů Rodič, Dospělý, Dítě, jejich psychopatologií, symptomatologií a diagnostikou v rámci TA. Následuje analýza transakcí, her a scénářů. Autor se zabývá i terapií psychóz a neuróz a TA aplikuje ve skupinové a manželské terapii. Svůj přístup ilustruje na řadě příkladů a dává jej do souvislosti s jinými psychoterapeutickými směry, zejména psychoanalýzou, přičemž dává nový obsah mnoha jejím pojmům. V závěru knihu je předložena jedna podrobná kazuistika a slovníček termínů.